Il territorio dell'Anglona ospita alcuni degli animali più rappresentativi della fauna sarda. Nel bosco e ai limiti di questo vivono il cinghiale e la volpe.

È possibile incontrare anche la lepre, il coniglio selvatico, la martora, la donnola. Tra i cieli delle alture si scorgono il corvo imperiale, le poiane, i gheppi e i gruccioni.

Nella macchia bassa e nella gariga vivono gli ultimi esemplari del cardellino, del passero sardo, della pernice, del calandro. Lungo il corso dei fiumi si posano, nei periodi di passo, aironi, morelle, germani reali, mestoloni, alzavole, canapiglie, fischioni.

Anche il maestoso airone cinerino soggiorna volentieri in questi lidi. La foce del Coghinas ospita d'inverno anatidi, ardeidi, folaghe e gabbiani, mentre nei suoi canneti nidificano la gallinella d'acqua, il tuffetto e la raganella.

Nelle acque del fiume si riproducono la tinca, il persico reale, la trota sarda, la carpa, l'anguilla. Tra le scogliere della costa anglonese vive invece la berta maggiore, un uccello divenuto ormai raro nelle isole del Mediterraneo.